Lista podstawowych wskazań obejmuje:
- profilaktyka chorób przewlekłych,
- wspomaganie leczenia nadwagi i otyłości,
- leczenie obrzęków,
- anemia,
- zaburzenia potencji,
- wspomaganie leczenia niepłodności
Ogólnoustrojowe działanie tlenowej terapii hiperbarycznej jest bezdyskusyjne. Korzyści z niej płynące opisane są już w podstawowej zasadzie działania HBOT, którą jest konieczne uczestnictwo tlenu w szeregu reakcji chemicznych w organizmie człowieka. Tlen jest podstawą procesów fizjologicznych niezbędnych dla zachowania homeostazy, a więc równowagi organizmu. Szczególne znaczenie ma dla oddychania tkankowego, dzięki któremu komórki uzyskują niezbędną energię oraz dla reakcji utleniania różnych związków chemicznych. Tlen stanowi także integralny element systemu uczestniczącego w metabolizowaniu leków, karcynogenów i innych substancji szkodliwych. Stąd znaczenie HBOT zarówno w profilaktyce chorób, ale i efektywnym funkcjonowaniu zdrowego człowieka, jest niepodważalne. Powyżej opisane zostały przykłady zastosowania medycyny hiperbarycznej w powiązaniu z konkretnymi wskazaniami. Jednakże tlenoterapia hiperbaryczna to nie tylko środek leczniczy, ale i profilaktyka ogólna. To także poprawa kondycji fizycznej, pozwalająca w wielu przypadkach uniknąć źródeł powstania niebezpieczeństw dla ludzkiego organizmu. Doskonałym odniesieniem i potwierdzeniem tego aspektu jest powszechne zastosowanie HBOT w medycynie sportowej nie tylko w potrzebie leczenia kontuzji, ale i jako metody w sposób naturalny podnoszącej wydolność i budującej energię człowieka.
Komora hiperbaryczna przynosi także dodatkowe wymierne korzyści. Już sam zabieg przeprowadzony w komorze hiperbarycznej przy ciśnieniu 1,5ata przez 60 minut pozwala na spalenie przez organizm nawet 500 kcal, oczywiście w zależności od cech indywidualnych pacjenta. Jest to niejako pozytywny skutek uboczny tlenoterapii. Trwały efekt HBOT w leczeniu nadwagi i otyłości ma związek z systematyzacją procesów metabolicznych, właściwą przemianą materii oraz zdecydowanie pozytywnym wpływem na cały układ trawienny.
Dotlenienie i rozrzedzenie krwi podczas zabiegu tlenoterapii hiperbarycznej i wynikająca z tego ogólnoustrojowa poprawa krążenia na wszystkich poziomach, powoduje lepsze ukrwienie wszystkich organów i narządów. Ma to niebagatelne znaczenie w leczeniu zaburzeń seksualnych, takich jak obniżone libido czy potencja. W tym zakresie pacjenci skuteczne działanie HBOT potwierdzają już po pierwszym zabiegu. Regulacja funkcjonowania całego organizmu w sposób prosty przekłada się na regulację cyklu miesięcznego u kobiet. Sesja w komorze hiperbarycznej ma także znaczenie relaksacyjne (zdecydowanie wpływa na poprawę nastroju).